正常人体肠道内寄居着数量庞大、种类繁多的微生物，以细菌为主，统称为肠道菌群，肠道菌群与人体之间的关系错综复杂，贯穿于人体各种生理活动和病理过程，已成为人体不可或缺的一部分。毫不夸张的说，肠道菌群，这个陪伴我们一生的“生物构造”，更像是我们体内一个尚未被认识的“器官”。
正常情况下，肠道菌群在体内与外部环境保持着动态平衡，如果这种平衡在某些情况下被打破，便形成肠道菌群失调。其表现为肠道菌群在种类、数量、比例、定位和生物学特性上的改变。已有文献报告了肠道微生态环境的改变与心脑血管疾病、呼吸系统疾病、肾脏疾病、内分泌代谢性疾病、神经精神性疾病等的关系，关于这些领域的研究正在逐步兴起和深入。
肠道菌群失调如何治疗
（1）积极治疗原发病，纠正可能的诱发因素，特别提醒，切勿滥用抗生素；
（2）调整机体的免疫功能和营养不良状态；
（3）合理应用益生菌、益生元及合生素等微生态制剂；
（4）粪便菌群移植（FMT），就是将健康人粪便中的功能菌群，移植到患者胃肠道内，重建具有正常功能的肠道菌群。目前，研究人员普遍认为，在其他抗生素药物治疗复发性艰难梭菌感染患者无效的前提下，可以尝试为患者提供这安全而有效的方法。随着FMT的临床研究日趋增多，FMT有望应用于炎症性肠病、肠易激综合征、便秘以及其他非胃肠道疾病，但对这些疾病的疗效、作用机制及安全性等仍有待进一步明确。
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